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中国首个国家基因库深圳开业运营,打造国民“生命银行”
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2016-09-22 中国首个国家基因库深圳开业运营,打造国民“生命银行”

基因测序仪未来的普及目标将是1000元。

【猎云网(微信号:ilieyun)北京】9月22日报道(文/竹子)

今天,位于深圳市的国家基因库正式运营。这是中国首个获批筹建的国家基因库,更是目前全世界最大的综合性基因库,由华大基因承建运营。

我国基因库承建较晚,5年前由国家发展改革委、财政部、工业和信息化部、原卫生部联合批复,是继美国国家生物技术信息中心(NCBI)、欧洲生物信息研究所(EBI)、日本DNA数据库(DDBJ)之后的全球第四个国家级基因库。

国家基因库坐落于被称为深圳大鹏半岛,国家基因库执行主任、华大基因研究院院长徐讯介绍说,即将投入使用的Ⅰ期建筑面积4.75万平方米。Ⅰ期建成后,综合能力世界第一,包括可访问数据量和数据存储能力是世界第一,可访问样本量和样本存储能力也是世界第一。

基因库里放什么

国家基因库一期工程主要是 “三库两平台”建设,即基因信息数据库(干库)、生物样本资源库(湿库)、生物活体库(活库)、数字化平台、基因编辑平台。

湿库里,在动物资源方面,基因库主要保存珍稀动物及具有重要经济价值的动物组织、细胞等。人类资源方面主要保存血液样本、组织样本、细胞系、细胞和尿液等,为重大疾病的前瞻性研究提供样本资源支撑,为疾病诊断与预测及个性化医疗等奠定基础。此外,湿库里还将存储植物资源、海洋资源和微生物资源。

而干库则储存基因、蛋白、分子、影像等多组学生物信息。

目前基因库拥有四十多个数据库,已完成近千种动物、植物、微生物基因组的数据收集和整理工作,占全球已完成大型基因组数量的80%以上,包括基因组、转录组、蛋白质组、表观组等多组学数据。

屏幕快照 2016-09-22 上午10.04.12

为什么要建基因库

在国家基因库建成前,我国每年产出的大量基因数据都存在国际三大数据库——NCBI、EBI、DDBJ中,在基因数据日益重要的今天,如果不能将我国独特的基因数据保存在国内,未来将面临巨大风险。

国家基因库除了作为一个“国库”来收集、保存生物样本资源和生物信息数据,还将对样本进行数字化,然后对数据进行解读、分析,并部分开放。

基因库开放性平台包括存储生物基因数据;提供生物信息检索,为开放性、公益性科研平台,向用户提供生物信息检索、比较、分析等服务;服务生命科学研究,向各科研机构提供生命科学研究平台。

“我们希望搭建起基因资源挖掘的基础性支撑平台,形成生命密码的存、读、懂、写、用能力于一体,聚焦生物医药、生物农业、微生物和海洋生物等领域,极大地缩短基础科研到科技成果转化应用周期。”梅永红说。

数据显示,当下已经实现对基因信息数据总量达60PB的访问支持,1000万份可溯源性生物样本的存储能力。目前我国基因库已和100多家科研机构建立合作。

华大基因董事长汪建说,每个人一生中所有关键阶段的标本都应该永久保存起来:从出生时的干细胞,到20岁时的免疫细胞,到30岁时的生殖细胞……而国家基因库,就是储存这些样本和数据的地方,像我们的“生命银行”。

据悉,目前该基因库自主研发的基因测序仪,已经将基因测序的成本降低,未来的普及目标将是1000元。

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